目前健保在小耳症手術方面是否給付的認定很模糊，有些醫院要求病患自費，有些醫院則接受健保給付。健保給付項目僅限小耳症第一次修補手術，給付額為90%，患者需負擔10% 的自付額。一般小耳症自體移植手術所需的三次手術包括在第一次修補手術範圍內，每次手術費用約在五萬元左右，所以每次自付額約為數千元。下顎延長術的手術費用健保也有給付，但是租用矯正器的費用需自費。